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Service Description: <div style='text-align:Left;'><div><div><p><span>To support the surveillance of key macroalgae and non-indigenous species in Nova Scotia and New Brunswick, five quantitative PCR (qPCR) assays were designed and tested at 111 sites in 2022-2023 targeting the following non-indigenous macroalgal species: Antithamnion sparsum, Bonnemaisonia hamifera, Codium fragile, Dasysiphonia japonica, Fucus serratus. All assays were developed in 2022 by the Center for Environmental Genomics Applications (CEGA, Newfoundland, Canada) except Antithamnion sparsum, for which an assay was developed in 2023 by the Aquatic Biotechnology Laboratory (ABL) at the Bedford Institute of Oceanography. All amplification was performed by the ABL in 2022-2023. The assay developed for Fucus serratus was later determined to be non-specific, and amplifies both F. serratus and Fucus distichus.</span></p><p><span>Cite this data as: Krumhansl K, Brooks C, Lowen B, DiBacco C, (2025). Quantitative PCR (qPCR) of Key Macroalgal Non-Indigenous Species in Nova Scotia and New Brunswick Waters. Version 1.5. Fisheries and Oceans Canada. Samplingevent dataset. https://ipt.iobis.org/obiscanada/resource?r=quantitative_qpcr_macroalgal_nonindigenous_species_novascotia_newbrunswick_2022_2023&amp;v=1.5</span></p><p><span>For additional information please see:</span></p><p><span>LeBlanc F., Belliveau V., Watson E., Coomber C., Simard N., DiBacco C., Bernier R., Gagné N. 2020. Environment DNA (eDNA) detection of marine aquatic invasive species (AIS) in Eastern Canada using a targeted species-specific qPCR approach. Management of Biological Invasions 11(2):201-217</span></p><p><span>Krumhansl K.A., Brooks C.M., Lowen B., O’Brien J., Wong M., DiBacco C. Loss, resilience and recovery of kelp forests in a region of rapid ocean warming. Annals of Botany 2024 Mar 8; 133(1):73-92</span></p><p><span>Brooks C.M., Krumhansl K.A. 2023. First record of the Asian Antithamnion sparsum Tokida, 1932 (Ceramiales, Rhodophyta) in Nova Scotia, Canada. BioInvasions Records 12(3):745-725.</span></p><p><a href='https://open.canada.ca:443/data/en/dataset/358c98e1-534d-4ed4-9853-13a5f437d79c' style='text-decoration:underline;'><span style='text-decoration:underline;'><span>Learn more or download this dataset from the Government of Canada's Open data portal.</span></span></a></p><p><span>Pour soutenir la surveillance des principales espèces de macroalgues et non indigènes en Nouvelle-Écosse et au Nouveau-Brunswick, on a conçu et testé cinq essais de PCR quantitative (qPCR) et sur 111 sites en 2022-2023, ciblant les espèces de macroalgues non indigènes suivantes : Antithamnion sparsum, Bonnemaisonia hamifera, Codium fragile, Dasysiphonia japonica et Fucus serratus. Tous les essais ont été élaborés en 2022 par le Center for Environmental Genomics Applications (CEGA, à Terre-Neuve, au Canada), à l’exception de l’essai pour Antithamnion sparsum, pour lequel un essai a été élaboré en 2023 par le Laboratoire de biotechnologie aquatique (LBA) de l’Institut océanographique de Bedford. Toutes les amplifications ont été effectuées par le LBA en 2022-2023. Le test mis au point pour Fucus serratus s’est avéré par la suite non spécifique et amplifie à la fois F. serratus et Fucus distichus.</span></p><p><span>Citer ces données comme: Krumhansl K, Brooks C, Lowen B, DiBacco C, (2025). Quantitative PCR (qPCR) of Key Macroalgal Non-Indigenous Species in Nova Scotia and New Brunswick Waters. Version 1.5. Fisheries and Oceans Canada. Samplingevent dataset. https://ipt.iobis.org/obiscanada/resource?r=quantitative_qpcr_macroalgal_nonindigenous_species_novascotia_newbrunswick_2022_2023&amp;v=1.5</span></p><p><span>Pour plus d'informations, voir:</span></p><p><span>LeBlanc F., Belliveau V., Watson E., Coomber C., Simard N., DiBacco C., Bernier R., Gagné N. 2020. Environment DNA (eDNA) detection of marine aquatic invasive species (AIS) in Eastern Canada using a targeted species-specific qPCR approach. Management of Biological Invasions 11(2):201-217</span></p><p><span>Krumhansl K.A., Brooks C.M., Lowen B., O’Brien J., Wong M., DiBacco C. Loss, resilience and recovery of kelp forests in a region of rapid ocean warming. Annals of Botany 2024 Mar 8; 133(1):73-92</span></p><p><span>Brooks C.M., Krumhansl K.A. 2023. First record of the Asian Antithamnion sparsum Tokida, 1932 (Ceramiales, Rhodophyta) in Nova Scotia, Canada. BioInvasions Records 12(3):745-725.</span></p><p><a href='https://open.canada.ca:443/data/fr/dataset/358c98e1-534d-4ed4-9853-13a5f437d79c' style='text-decoration:underline;'><span style='text-decoration:underline;'><span>Apprenez-en plus ou téléchargez cet ensemble de données à partir du portail de données ouvertes du gouvernement du Canada.</span></span></a></p></div></div></div>
Map Name: Quantitative PCR (qPCR) of Key Macroalgal Non-Indigenous Species in Nova Scotia and New Brunswick Waters PCR quantitative (qPCR) des principales espèces de macroalgues non indigènes dans les eaux de la Nouvelle-Écosse et du Nouveau-Brunswick
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Description: To support the surveillance of key macroalgae and non-indigenous species in Nova Scotia and New Brunswick, five quantitative PCR (qPCR) assays were designed and tested at 111 sites in 2022-2023 targeting the following non-indigenous macroalgal species: Antithamnion sparsum, Bonnemaisonia hamifera, Codium fragile, Dasysiphonia japonica, Fucus serratus. All assays were developed in 2022 by the Center for Environmental Genomics Applications (CEGA, Newfoundland, Canada) except Antithamnion sparsum, for which an assay was developed in 2023 by the Aquatic Biotechnology Laboratory (ABL) at the Bedford Institute of Oceanography. All amplification was performed by the ABL in 2022-2023. The assay developed for Fucus serratus was later determined to be non-specific, and amplifies both F. serratus and Fucus distichus.Cite this data as: Krumhansl K, Brooks C, Lowen B, DiBacco C, (2025). Quantitative PCR (qPCR) of Key Macroalgal Non-Indigenous Species in Nova Scotia and New Brunswick Waters. Version 1.5. Fisheries and Oceans Canada. Samplingevent dataset. https://ipt.iobis.org/obiscanada/resource?r=quantitative_qpcr_macroalgal_nonindigenous_species_novascotia_newbrunswick_2022_2023&amp;v=1.5For additional information please see:LeBlanc F., Belliveau V., Watson E., Coomber C., Simard N., DiBacco C., Bernier R., Gagné N. 2020. Environment DNA (eDNA) detection of marine aquatic invasive species (AIS) in Eastern Canada using a targeted species-specific qPCR approach. Management of Biological Invasions 11(2):201-217Krumhansl K.A., Brooks C.M., Lowen B., O’Brien J., Wong M., DiBacco C. Loss, resilience and recovery of kelp forests in a region of rapid ocean warming. Annals of Botany 2024 Mar 8; 133(1):73-92Brooks C.M., Krumhansl K.A. 2023. First record of the Asian Antithamnion sparsum Tokida, 1932 (Ceramiales, Rhodophyta) in Nova Scotia, Canada. BioInvasions Records 12(3):745-725.Learn more or download this dataset from the Government of Canada's Open data portal.Pour soutenir la surveillance des principales espèces de macroalgues et non indigènes en Nouvelle-Écosse et au Nouveau-Brunswick, on a conçu et testé cinq essais de PCR quantitative (qPCR) et sur 111 sites en 2022-2023, ciblant les espèces de macroalgues non indigènes suivantes : Antithamnion sparsum, Bonnemaisonia hamifera, Codium fragile, Dasysiphonia japonica et Fucus serratus. Tous les essais ont été élaborés en 2022 par le Center for Environmental Genomics Applications (CEGA, à Terre-Neuve, au Canada), à l’exception de l’essai pour Antithamnion sparsum, pour lequel un essai a été élaboré en 2023 par le Laboratoire de biotechnologie aquatique (LBA) de l’Institut océanographique de Bedford. Toutes les amplifications ont été effectuées par le LBA en 2022-2023. Le test mis au point pour Fucus serratus s’est avéré par la suite non spécifique et amplifie à la fois F. serratus et Fucus distichus.Citer ces données comme: Krumhansl K, Brooks C, Lowen B, DiBacco C, (2025). Quantitative PCR (qPCR) of Key Macroalgal Non-Indigenous Species in Nova Scotia and New Brunswick Waters. Version 1.5. Fisheries and Oceans Canada. Samplingevent dataset. https://ipt.iobis.org/obiscanada/resource?r=quantitative_qpcr_macroalgal_nonindigenous_species_novascotia_newbrunswick_2022_2023&amp;v=1.5Pour plus d'informations, voir:LeBlanc F., Belliveau V., Watson E., Coomber C., Simard N., DiBacco C., Bernier R., Gagné N. 2020. Environment DNA (eDNA) detection of marine aquatic invasive species (AIS) in Eastern Canada using a targeted species-specific qPCR approach. Management of Biological Invasions 11(2):201-217Krumhansl K.A., Brooks C.M., Lowen B., O’Brien J., Wong M., DiBacco C. Loss, resilience and recovery of kelp forests in a region of rapid ocean warming. Annals of Botany 2024 Mar 8; 133(1):73-92Brooks C.M., Krumhansl K.A. 2023. First record of the Asian Antithamnion sparsum Tokida, 1932 (Ceramiales, Rhodophyta) in Nova Scotia, Canada. BioInvasions Records 12(3):745-725.Apprenez-en plus ou téléchargez cet ensemble de données à partir du portail de données ouvertes du gouvernement du Canada.
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Title: Quantitative PCR (qPCR) of key macroalgal non-indigenous species in Nova Scotia and New Brunswick waters / PCR quantitative (qPCR) des principales espèces de macroalgues non indigènes dans les eaux de la Nouvelle-Écosse et du Nouveau-Brunswick
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Subject: To support the surveillance of key macroalgae and non-indigenous species in Nova Scotia and New Brunswick, five quantitative PCR (qPCR) assays were designed and tested at 111 sites in 2022-2023 targeting the following non-indigenous macroalgal species: Antithamnion sparsum, Bonnemaisonia hamifera, Codium fragile, Dasysiphonia japonica, Fucus serratus. / Pour soutenir la surveillance des principales espèces de macroalgues et non indigènes en Nouvelle-Écosse et au Nouveau-Brunswick, on a conçu et testé cinq essais de PCR quantitative (qPCR) et sur 111 sites en 2022-2023, ciblant les espèces de macroalgues non indigènes suivantes : Antithamnion sparsum, Bonnemaisonia hamifera, Codium fragile, Dasysiphonia japonica et Fucus serratus.
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Keywords: Oceans,Environment,Biota,Nova Scotia,New Brunswick,Invasive species,Coastal waters,eDNA,Non-indigenous species,Macroalgae,Océans,Environnement,Biologie,faune et flore,Nouvelle-Écosse,Nouveau-Brunswick,Océan,Espèce envahissante,Eaux côtières,ADNe,Espèces non indigènes,Macroalgues
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