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open_data_donnees_ouvertes/widespread_genetic_nw_atlantic_horse_mussel (MapServer)

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Service Description: <div style='text-align:Left;'><div><div><p><span>Effective conservation planning relies on understanding population connectivity which can be informed by genomic data. This is particularly important for sessile species like the horse mussel (Modiolus modiolus), a key habitat-forming species and conservation priority in Atlantic Canada), yet little genomic information is available to describe horse mussel connectivity patterns. We used more than 8000 restriction-site associated DNA sequencing-derived single nucleotide polymorphisms and a panel of 8 microsatellites to examine genomic connectivity among horse mussel populations in the Bay of Fundy, along the Scotian Shelf, and in the broader northwestern Atlantic extending to Newfoundland. Despite phenotypic differences between sampling locations, we found an overall lack of genetic diversity and population structure in horse mussels in the Northwest Atlantic Ocean. All sampled locations had low heterozygosity, very low FST, elevated inbreeding coefficients, and deviated from Hardy-Weinberg Equilibrium, highlighting generally low genetic diversity across all metrics. Principal components analysis, Admixture analysis, pairwise FST calculations, and analysis of outlier loci (potentially under selection) all showed no independent genomic clusters within the data, and an analysis of molecular variance showed that less than 1% of the variation within the SNP dataset was found between sampling locations. Our results suggest that connectivity is high among horse mussel populations in the Northwest Atlantic, and coupled with large effective population sizes, this has resulted in minimal genomic divergence across the region. These results can inform conservation design considerations in the Bay of Fundy and support further integration into the broader regional conservation network.</span></p><p><span>Cite this data as: Van Wyngaarden, Mallory et al. (2024). Widespread genetic similarity between Northwest Atlantic populations of the horse mussel, Modiolus modiolus. Published: April 2025. Coastal Ecosystem Science Division, Maritimes Region, Fisheries and Oceans Canada, Dartmouth, NS.</span></p><p style='margin:0 0 11 0;'><a href='https://open.canada.ca/data/en/dataset/cc3e54d1-354a-4b03-8188-db64a79b7491' style='text-decoration:underline;'><span style='text-decoration:underline;'><span>Learn more or download this dataset from the Government of Canada's Open data portal.</span></span></a></p><p><span>Une planification efficace de la conservation repose sur la compréhension de la connectivité entre les populations, qui peut être documentée par des données génomiques. Ceci est particulièrement important pour les espèces sessiles comme la modiole (Modiolus modiolus), une espèce essentielle à la formation de certains habitats qui constitue une priorité en matière de conservation au Canada atlantique. Cependant, peu d’informations génomiques sont disponibles pour décrire les tendances en matière de connectivité de la modiole. Nous avons utilisé plus de 8 000 polymorphismes mononucléotidiques dérivés du séquençage de l’ADN associé aux sites de restriction et un ensemble de 8 microsatellites pour examiner la connectivité génomique entre les populations de modioles dans la baie de Fundy, le long du plateau néo-écossais et dans l’Atlantique Nord-Ouest, jusqu’à Terre-Neuve. Malgré les différences phénotypiques entre les lieux d’échantillonnage, nous avons constaté un manque général de diversité génétique et de structure démographique chez les modioles dans l’Atlantique Nord-Ouest. Tous les sites échantillonnés présentaient une faible hétérozygosité, un très faible FST, des coefficients de consanguinité élevés et un écart par rapport à l’équilibre Hardy-Weinberg, ce qui met en évidence la diversité génétique généralement faible pour tous les paramètres mesurés. L’analyse des composantes principales, l’analyse du métissage, les calculs par paires du FST et l’analyse des loci aberrants (pouvant faire l’objet d’une sélection) n’ont révélé aucun groupe génomique indépendant dans les données, et une analyse de la variation moléculaire a montré que moins de 1 % de la variation observée dans l’ensemble de données sur les SNP était constatée entre les sites d’échantillonnage. Nos résultats suggèrent que la connectivité est élevée entre les populations de modioles de l’Atlantique Nord-Ouest, ce qui, conjugué à des tailles de population réelles importantes, a entraîné une divergence génomique minimale dans la région. Ces résultats peuvent éclairer les considérations relatives à la conception de mesures de conservation dans la baie de Fundy et favoriser une meilleure intégration dans l’ensemble du réseau régional de conservation.</span></p><p><span>Citer ces données comme: an Wyngaarden, Mallory et al. (2024).Similarité génétique répandue entre les populations de modioles (Modiolus modiolus) de l’Atlantique Nord-Ouest. Publié en Avril 2025. Division de la science des écosystèmes côtiers, Région du Maritimes, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É).</span></p><p style='margin:0 0 11 0;'><a href='https://open.canada.ca/data/fr/dataset/cc3e54d1-354a-4b03-8188-db64a79b7491' style='text-decoration:underline;'><span style='text-decoration:underline;'><span>Apprenez-en plus ou téléchargez cet ensemble de données à partir du portail de données ouvertes du gouvernement du Canada.</span></span></a></p><p><span /></p></div></div></div>

Map Name: Widespread genetic similarity between Northwest Atlantic populations of the horse mussel, Modiolus modiolus Similarité génétique répandue entre les populations de modioles (Modiolus modiolus) de l’Atlantique Nord-Ouest

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Layers: Description: Effective conservation planning relies on understanding population connectivity which can be informed by genomic data. This is particularly important for sessile species like the horse mussel (Modiolus modiolus), a key habitat-forming species and conservation priority in Atlantic Canada), yet little genomic information is available to describe horse mussel connectivity patterns. We used more than 8000 restriction-site associated DNA sequencing-derived single nucleotide polymorphisms and a panel of 8 microsatellites to examine genomic connectivity among horse mussel populations in the Bay of Fundy, along the Scotian Shelf, and in the broader northwestern Atlantic extending to Newfoundland. Despite phenotypic differences between sampling locations, we found an overall lack of genetic diversity and population structure in horse mussels in the Northwest Atlantic Ocean. All sampled locations had low heterozygosity, very low FST, elevated inbreeding coefficients, and deviated from Hardy-Weinberg Equilibrium, highlighting generally low genetic diversity across all metrics. Principal components analysis, Admixture analysis, pairwise FST calculations, and analysis of outlier loci (potentially under selection) all showed no independent genomic clusters within the data, and an analysis of molecular variance showed that less than 1% of the variation within the SNP dataset was found between sampling locations. Our results suggest that connectivity is high among horse mussel populations in the Northwest Atlantic, and coupled with large effective population sizes, this has resulted in minimal genomic divergence across the region. These results can inform conservation design considerations in the Bay of Fundy and support further integration into the broader regional conservation network.Cite this data as: Van Wyngaarden, Mallory et al. (2024). Widespread genetic similarity between Northwest Atlantic populations of the horse mussel, Modiolus modiolus. Published: April 2025. Coastal Ecosystem Science Division, Maritimes Region, Fisheries and Oceans Canada, Dartmouth, NS.Learn more or download this dataset from the Government of Canada's Open data portal.Une planification efficace de la conservation repose sur la compréhension de la connectivité entre les populations, qui peut être documentée par des données génomiques. Ceci est particulièrement important pour les espèces sessiles comme la modiole (Modiolus modiolus), une espèce essentielle à la formation de certains habitats qui constitue une priorité en matière de conservation au Canada atlantique. Cependant, peu d’informations génomiques sont disponibles pour décrire les tendances en matière de connectivité de la modiole. Nous avons utilisé plus de 8 000 polymorphismes mononucléotidiques dérivés du séquençage de l’ADN associé aux sites de restriction et un ensemble de 8 microsatellites pour examiner la connectivité génomique entre les populations de modioles dans la baie de Fundy, le long du plateau néo-écossais et dans l’Atlantique Nord-Ouest, jusqu’à Terre-Neuve. Malgré les différences phénotypiques entre les lieux d’échantillonnage, nous avons constaté un manque général de diversité génétique et de structure démographique chez les modioles dans l’Atlantique Nord-Ouest. Tous les sites échantillonnés présentaient une faible hétérozygosité, un très faible FST, des coefficients de consanguinité élevés et un écart par rapport à l’équilibre Hardy-Weinberg, ce qui met en évidence la diversité génétique généralement faible pour tous les paramètres mesurés. L’analyse des composantes principales, l’analyse du métissage, les calculs par paires du FST et l’analyse des loci aberrants (pouvant faire l’objet d’une sélection) n’ont révélé aucun groupe génomique indépendant dans les données, et une analyse de la variation moléculaire a montré que moins de 1 % de la variation observée dans l’ensemble de données sur les SNP était constatée entre les sites d’échantillonnage. Nos résultats suggèrent que la connectivité est élevée entre les populations de modioles de l’Atlantique Nord-Ouest, ce qui, conjugué à des tailles de population réelles importantes, a entraîné une divergence génomique minimale dans la région. Ces résultats peuvent éclairer les considérations relatives à la conception de mesures de conservation dans la baie de Fundy et favoriser une meilleure intégration dans l’ensemble du réseau régional de conservation.Citer ces données comme: an Wyngaarden, Mallory et al. (2024).Similarité génétique répandue entre les populations de modioles (Modiolus modiolus) de l’Atlantique Nord-Ouest. Publié en Avril 2025. Division de la science des écosystèmes côtiers, Région du Maritimes, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É).Apprenez-en plus ou téléchargez cet ensemble de données à partir du portail de données ouvertes du gouvernement du Canada.

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