open_data_donnees_ouvertes/esi_edna_offshore

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Service Description: <div style='text-align:Left;'><div><div>The Eastern Shore Islands Area of Interest (AOI) is a large coastal AOI in the Maritimes Region spanning 2089 km2 and extending along 100 km of coastline. While much of the data that led to the area's designation as an AOI was collected in the nearshore coastal areas (i.e., seagrass and kelp distributions, coastal bird nesting sites, herring spawning areas), there is less information available on the fish and invertebrate community structure in offshore areas of the AOI. Current offshore sampling effort is primarily focused in the Summer multi-species RV survey which covers the Scotian Shelf but does not sample within the depth range covered by the AOI (~ <100m depth). Environmental DNA (eDNA) offers a promising approach for biodiversity monitoring that has been gaining increased attention in the marine realm. Through sampling relatively small volumes of water (~1-5 L), eDNA can capture of millions of fragments of eDNA on filters that can then be sequenced to identify the species composition of an area. eDNA metabarcoding is based on the foundations of DNA barcoding, where species are identified solely by their unique DNA sequences. eDNA metabarcoding relies on a comprehensive reference library of gene sequences from known species to rapidly identify which species are captured in every water sample. This method is relatively simple, efficient (with the ability to characterize both fish and invertebrate diversity), and non-invasive, meaning there is no disruption of sensitive benthic habitats or need to dissect tissue samples from captured fish and invertebrates. eDNA has been shown to be comparable to other biodiversity censusing techniques and has the potential to rapidly conduct biodiversity surveys over a relatively large area, such as the Eastern Shore Islands AOI. Our eDNA sampling in the Eastern Shore Islands targets fish and invertebrates using multiple genetic markers (e.g., 12S and COI) to obtain baseline information on these communities across transects spanning from inshore to offshore in the AOI. Over time, we will investigate changes in species richness and community composition using annual eDNA surveys as an ongoing monitoring tool for this coastal region.Cite this data as: Jeffery, N.W. Environmental DNA Monitoring in the Eastern Shore Islands Area of Interest - Offshore. Published: March 2026. Coastal Ecosystems Science Division, Maritimes Region, Fisheries and Oceans Canada, Dartmouth NS.<a href='https://open.canada.ca/data/en/dataset/0fe7b19d-864c-47fa-b533-c38a09519f9d' style='text-decoration:underline;'>Learn more or download this dataset from the Government of Canada's Open data portal.</a>----------Le site d’intérêt (SI) des îles de la côte Est constitue un grand SI côtier dans la région des Maritimes d’une superficie de 2 089 km2 et qui s’étend sur 100 km de littoral. Bien qu’une grande partie des données qui ont mené à la désignation de la zone comme site d’intérêt aient été recueillies dans les zones côtières (c.-à-d. répartition de la zostère marine et du varech, sites de nidification des oiseaux côtiers et frayères du hareng), il y a moins d’information disponible sur la structure des communautés de poissons et d’invertébrés dans les zones extracôtières du site d’intérêt. L’effort d’échantillonnage actuel au large des côtes est principalement axé sur le relevé plurispécifique estival par navire de recherche qui couvre le plateau néo-écossais, mais qui n’effectue pas d’échantillonnage dans la fourchette des profondeurs couverte par le SI (moins de 100 m de profondeur environ). L’ADN environnemental (ADNe) constitue une approche prometteuse pour la surveillance de la biodiversité qui fait l’objet d’une attention accrue dans le domaine marin. L’échantillonnage de volumes d’eau relativement petits (de 1 à 5 litres environ) permet de capturer des millions de fragments d’ADNe sur des filtres que l’on peut ensuite séquencer en vue d’identifier la composition des espèces d’une zone donnée. Le métacodage à barres de l’ADNe repose sur les principes du codage à barres de l’ADN, qui consiste à identifier les espèces uniquement à partir de leurs séquences d’ADN uniques. Le métacodage par barres de l’ADNe s’appuie sur une bibliothèque de références exhaustive de séquences génétiques d’espèces connues, permettant ainsi d’identifier rapidement les espèces capturées dans chaque échantillon d’eau. Cette méthode est relativement simple, efficace (elle permet de caractériser la diversité des poissons et des invertébrés à la fois) et non invasive, ce qui signifie qu’elle ne perturbe pas les habitats benthiques vulnérables et ne nécessite pas de dissection des échantillons de tissus prélevés sur les poissons et les invertébrés capturés. L’ADNe s’est révélé comparable à d’autres techniques de recensement de la biodiversité et offre la possibilité de réaliser rapidement des relevés sur la biodiversité dans une zone relativement vaste, comme le site d’intérêt des îles de la côte Est. Notre échantillonnage de l’ADNe dans les îles de la côte Est cible les poissons et les invertébrés au moyen de plusieurs marqueurs génétiques (p. ex. 12S et COI), en vue d’obtenir des renseignements de base sur ces communautés dans des transects s’étendant de la zone côtière à la zone extracôtière du site d’intérêt. Au fil du temps, nous étudierons les changements dans la richesse des espèces et la composition des communautés en utilisant les relevés annuels de l’ADNe comme outil de surveillance continue pour cette région côtière.Citer ces données comme: Jeffery, N.W.Surveillance de l’ADN environnemental au large de la zone d’intérêt des îles de la côte Est. Publié en mars 2026. Division de la science des écosystèmes côtiers, Région du Maritimes, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É).<a href='https://open.canada.ca/data/fr/dataset/0fe7b19d-864c-47fa-b533-c38a09519f9d' style='text-decoration:underline;'>Apprenez-en plus ou téléchargez cet ensemble de données à partir du portail de données ouvertes du gouvernement du Canada.</a></div></div></div>

Map Name: Environmental DNA Monitoring in the Eastern Shore Islands Area of Interest - Offshore Surveillance de l’ADN environnemental au large de la zone d’intérêt des îles de la côte Est

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Sampling metadata of eDNA in the Eastern Shore Islands in 2022 / Échantillonnage des métadonnées de l'ADN environnemental dans les îles de la côte Est en 2022 (0)

Description: The Eastern Shore Islands Area of Interest (AOI) is a large coastal AOI in the Maritimes Region spanning 2089 km2 and extending along 100 km of coastline. While much of the data that led to the area's designation as an AOI was collected in the nearshore coastal areas (i.e., seagrass and kelp distributions, coastal bird nesting sites, herring spawning areas), there is less information available on the fish and invertebrate community structure in offshore areas of the AOI. Current offshore sampling effort is primarily focused in the Summer multi-species RV survey which covers the Scotian Shelf but does not sample within the depth range covered by the AOI (~ <100m depth). Environmental DNA (eDNA) offers a promising approach for biodiversity monitoring that has been gaining increased attention in the marine realm. Through sampling relatively small volumes of water (~1-5 L), eDNA can capture of millions of fragments of eDNA on filters that can then be sequenced to identify the species composition of an area. eDNA metabarcoding is based on the foundations of DNA barcoding, where species are identified solely by their unique DNA sequences. eDNA metabarcoding relies on a comprehensive reference library of gene sequences from known species to rapidly identify which species are captured in every water sample. This method is relatively simple, efficient (with the ability to characterize both fish and invertebrate diversity), and non-invasive, meaning there is no disruption of sensitive benthic habitats or need to dissect tissue samples from captured fish and invertebrates. eDNA has been shown to be comparable to other biodiversity censusing techniques and has the potential to rapidly conduct biodiversity surveys over a relatively large area, such as the Eastern Shore Islands AOI. Our eDNA sampling in the Eastern Shore Islands targets fish and invertebrates using multiple genetic markers (e.g., 12S and COI) to obtain baseline information on these communities across transects spanning from inshore to offshore in the AOI. Over time, we will investigate changes in species richness and community composition using annual eDNA surveys as an ongoing monitoring tool for this coastal region.Cite this data as: Jeffery, N.W. Environmental DNA Monitoring in the Eastern Shore Islands Area of Interest - Offshore. Published: March 2026. Coastal Ecosystems Science Division, Maritimes Region, Fisheries and Oceans Canada, Dartmouth NS.Learn more or download this dataset from the Government of Canada's Open data portal.----------Le site d’intérêt (SI) des îles de la côte Est constitue un grand SI côtier dans la région des Maritimes d’une superficie de 2 089 km2 et qui s’étend sur 100 km de littoral. Bien qu’une grande partie des données qui ont mené à la désignation de la zone comme site d’intérêt aient été recueillies dans les zones côtières (c.-à-d. répartition de la zostère marine et du varech, sites de nidification des oiseaux côtiers et frayères du hareng), il y a moins d’information disponible sur la structure des communautés de poissons et d’invertébrés dans les zones extracôtières du site d’intérêt. L’effort d’échantillonnage actuel au large des côtes est principalement axé sur le relevé plurispécifique estival par navire de recherche qui couvre le plateau néo-écossais, mais qui n’effectue pas d’échantillonnage dans la fourchette des profondeurs couverte par le SI (moins de 100 m de profondeur environ). L’ADN environnemental (ADNe) constitue une approche prometteuse pour la surveillance de la biodiversité qui fait l’objet d’une attention accrue dans le domaine marin. L’échantillonnage de volumes d’eau relativement petits (de 1 à 5 litres environ) permet de capturer des millions de fragments d’ADNe sur des filtres que l’on peut ensuite séquencer en vue d’identifier la composition des espèces d’une zone donnée. Le métacodage à barres de l’ADNe repose sur les principes du codage à barres de l’ADN, qui consiste à identifier les espèces uniquement à partir de leurs séquences d’ADN uniques. Le métacodage par barres de l’ADNe s’appuie sur une bibliothèque de références exhaustive de séquences génétiques d’espèces connues, permettant ainsi d’identifier rapidement les espèces capturées dans chaque échantillon d’eau. Cette méthode est relativement simple, efficace (elle permet de caractériser la diversité des poissons et des invertébrés à la fois) et non invasive, ce qui signifie qu’elle ne perturbe pas les habitats benthiques vulnérables et ne nécessite pas de dissection des échantillons de tissus prélevés sur les poissons et les invertébrés capturés. L’ADNe s’est révélé comparable à d’autres techniques de recensement de la biodiversité et offre la possibilité de réaliser rapidement des relevés sur la biodiversité dans une zone relativement vaste, comme le site d’intérêt des îles de la côte Est. Notre échantillonnage de l’ADNe dans les îles de la côte Est cible les poissons et les invertébrés au moyen de plusieurs marqueurs génétiques (p. ex. 12S et COI), en vue d’obtenir des renseignements de base sur ces communautés dans des transects s’étendant de la zone côtière à la zone extracôtière du site d’intérêt. Au fil du temps, nous étudierons les changements dans la richesse des espèces et la composition des communautés en utilisant les relevés annuels de l’ADNe comme outil de surveillance continue pour cette région côtière.Citer ces données comme: Jeffery, N.W.Surveillance de l’ADN environnemental au large de la zone d’intérêt des îles de la côte Est. Publié en mars 2026. Division de la science des écosystèmes côtiers, Région du Maritimes, Pêches et Océans Canada, Dartmouth, (N-É).Apprenez-en plus ou téléchargez cet ensemble de données à partir du portail de données ouvertes du gouvernement du Canada.

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Copyright Text: Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Coastal Ecosystem Science Division (CESD)/Gouvernement du Canada; Pêches et Océans Canada; Division des sciences des écosystèmes côtiers (DSEC)

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